Στο Τμήμα λειτουργούν τα κάτωθι θεσμοθετημένα εργαστήρια:
- Θέρμανσης-Ψύξης-Κλιματισμού (ΘΨΚ)
- Ρευστομηχανικής & Ρευστοδυναμικών Μηχανών (ΕΡΡΜ)
- Ανάλυσης Υλικών & Κατασκευών (ΕΑΥΚ)
- Κατεργασιών & Διαμορφώσεων (ΕΚΔ)
- Μηχανικής – Υλικών – Μηχανών (MYM)
- Χημικής & Περιβαλλοντικής Τεχνολογίας (ΕΧΗΠΕΤ).
Τα παραπάνω εργαστήρια υποστηρίζουν τις ερευνητικές δραστηριότητες και την παροχή διδακτικού έργου που σχετίζεται με τις δύο κατευθύνσεις σπουδών του Τμήματος. Πιο συγκεκριμένα, τα εργαστήρια ΘΨΚ, ΕΡΡΜ και ΕΧΗΠΕΤ σχετίζονται με την κατεύθυνση «Ενέργειας & Περιβάλλοντος» ενώ τα εργαστήρια ΕΑΥΚ, ΕΚΔ και ΜΥΜ με την κατεύθυνση «Μηχανολογικών Κατασκευών & Εγκαταστάσεων».
Επιπρόσθετα το Τμήμα διαθέτει μια σειρά εργαστηριακών χώρων για εκπαιδευτικούς σκοπούς, όπως είναι τα εργαστήρια:
- Φυσικής,
- Ατμολεβήτων-Ατμοστροβίλων,
- Μηχανών Εσωτερικής Καύσης
καθώς και μια σειρά εκπαιδευτικών δομών, όπως σχεδιαστήρια, κέντρο Υπολογιστών, αίθουσες διδασκαλίας, κα.